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导致番茄卷叶黄叶的原因归纳起来主要是人为损伤根系。
划锄是番茄定植缓苗后的一项重要管理措施。它可保持土壤墒情、增加土壤的透气性，进而起到促进根系深扎的作用。
但是，生产中不少菜农在进行划锄时过深，特别是在植株附近划锄过深，结果造成了番茄大量新生毛细根受到损伤，进而导致了根系吸水量小，不能满足蒸腾作用的需求，因而造成了番茄卷叶。同时，因根系受伤，使得植株所需的内源生长素供应不足，因而又造成了叶片的黄化。
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