跨境电商的发展方兴未艾，仓储物流也成为搏杀的主要战场之一：自2014年起，跨境电商纷纷发布与国内保税区合作的消息。比如，聚美在郑州保税区建成自理仓，京东瞄准加入郑州“E贸易”生态圈，阿里巴巴与珠海保税区共建电商平台，而跨境母婴电商蜜芽更是一口气抢先占领了国内三大知名保税仓。
2014年7月，蜜芽正式落户宁波保税区，成立宁波蜜芽国际贸易有限公司，申请加盟宁波保税区跨境电子商务试点企业行列获批。“蜜芽跨境购专区”于同年8月正式上线。依托宁波保税区开展的跨境贸易电子商务合作，蜜芽的商品全部采用“保税区现货”模式，从日本韩国等地采购的商品直接运送到宁波保税区，经由海关、中国检验检疫部门等相关部门办理正规进口手续。消费者通过保税区跨境平台进行网购，能够准确了解所购商品的进口日期、口岸、国家、品牌商等信息，网购的时间也会因此而缩短，从而有效地降低了物流成本，有利于给消费者提供更加有保障的商品和服务。
同年10月，蜜芽又进驻广州保税区，从美国等海外采购的商品将直接运送到广州保税区，经由海关、中国检验检疫部门等相关部门办理正规进口手续。
2015年6月，蜜芽再次宣布战略投资重庆西永综合保税区，未来将对接重庆“渝新欧”国际铁运输通道，将拓展更多上游欧洲品牌供应商。重庆位于“新丝绸之经济带”和“21世纪海上丝绸之”的交汇点，是国家选定的“一带一“内陆核心城市。渝新欧铁连接欧亚，对中欧贸易有强劲影响。在国内跨境电商与保税区合作的历史中，货物都是从欧洲采用海运的方式，一趟大约要花40多天的时间。而蜜芽搭上“渝新欧”国际铁通道的东风之后，只需14天左右，大大缩短了货物运输时间，降低了运输成本。
在海外布局上，蜜芽将供应链向上游扩展，先后在日本和成立了贸易公司，宁波保税区主要负责来自日本、韩国的货品。来自宁波海关的最新数据显示，蜜芽在进口货物总值和海关放行单量均位居宁波保税区第一；广州保税区则集中了来自美国、的商品；而重庆保税仓则是得益于其在西部的地缘优势，以及直接与欧洲连通的“渝新欧”铁。这种布局方式，不仅有利于采购，还能更好地在当地处理过关、仓储、中转、物流等问题。
蜜芽方面表示，物流和仓储是保障跨境电商运行的硬件储备，供应链则是跨境电商的生命线。跨境电商对上游供应链的把控更是命门。因此，谁能掌握上游供应商拿到更多货源谁才可能获得更大的发展。