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科学文献与科学数据关联实践研究

※发布时间:2018-11-21 6:06:15   ※发布作者:habao   ※出自何处: 

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  数据密集型科研下,将科学数据与科学文献相关联,形成科学内容的完整体,使文献和数据共同服务于科学研究,成为期刊界、数据库出版商、科研组织等关心的热点问题。

  Elsevier借鉴AOF项目的研究,将科学文献和科学数据进行关联展现。其中重点包括科学数据与学术论文的关联与实现。Elsevier希望通过将科学数据与学术论文进行关联,完善论文的上下文,构建完整的论文产出。主要通过Science Direct实现数据与研究文献的关联服务,在Science Direct上建立在线文献与数据仓储之间的双向链接,将Science Direct上的文献链接到研究数据集,或是将数据集链接到研究文献。基于数据和数据仓储的性质,选择具体关联方式以及呈现信息的效果。读者通过一次点击就可以获取可信的相关数据,从而帮助验证研究、推动进一步的研究调查。

  无论是哪种类型的关联服务方式,它们的目标都是将可靠的数据和信息置于研究出版物的上下文中,使研究者能更方便地发现与其研究工作相关的出版物或数据集等资料。Elsevier提供多种链接模式或数据链接APP方式将文献与科学数据仓储关联起来,其服务覆盖了广泛的学科领域,链接了包括Protein Data Bank、Encyclopedia of Life、Cambridge Crystallographic Data Center、EarthChem、PANGAEA、SIMBAD Astronomical Database、Clinical Trials.gov在内的50多个科学数据仓储[21]。部分科学数据仓储及其关联方式如表1所示。

  Elsevier支持多种方式将科学文献与科学数据进行关联,表1中列出了部分与科学数据仓储的关联方式。通过分析AOF项目以及Elsevier与50余个科学数据仓储的关联实践,总结归纳如下四种Elsevier科学文献与科学数据的关联方式,并深入分析其关联行为。

  数据DOI是科学数据仓储赋予科学数据的唯一标识符。Elsevier创建了一个一般化的机制,在Science Direct的学术论文页面创建可验证式数据DOI,链接到外部数据仓储,该数据DOI通过一个标识图标来显示。每当用户浏览文章的HTML版本时,一个包含数据DOI的链接请求即被发送至外部数据仓储,询问该篇文章相关数据集的可获得性。如果得到的回复是可以,一张包含通向数据集超链接的可见图标将被返回,示意使用者数据仓储存有这篇文章的数据集。如果得到的回复是不可以,数据库会返回一张像素为1×l的透明图像。由于这张图对于用户来说是透明不可见的,因此他们无法看到任何可链接到数据(存储于该数据仓储中的数据)的链接。

  在作者行文过程中,对使用或参考的数据集进行直接标注,通过自行标注数据DOI的方式直接链接到相关的数据集。这种方式要求对应的科学数据仓储具有标准的数据DOI关联方式,并且作者对数据集比较熟悉,能够较为精准地进行数据DOI标注。例如,对于Atmospheric Radiation Measurement Data Archive、Dataverse、The Cancer Imaging Archive(TCIA)、4Tu.Datacentrum等比较著名的科学数据仓储,作者往往在行文中能够自行标注数据DOI。

  4)在文章的展示页面上,基于数据DOI,数据仓储创建一个标识图标(如果可以获取的线)Science Direct的使用者看到(同时可以使用)这个从Science Direct链接到数据库的链接。

  点击该标识图标就可以将读者直接链接到相关数据记录。这种出版后进行标注的优势在于,可以在文献出版之后将数据与文献关联起来(甚至是很多年之后),这对于利用现有技术来获取之前存储的数据是尤其有效的。对于那些希望在一段时间之后再数据的研究者来说也非常合适,因为他们可以在提交论文或数据时,要求数据仓储在某个时间点后进行数据DOI的标注与关联。

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